RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 HTR1BP28222 390 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 RPL3P39023 403 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PIK3CBP42338 1070 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SELENOWP63302 87 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 VN1R5Q7Z5H4 357 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PDZD3Q86UT5 571 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 ZBTB46Q86UZ6 589 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 CROCCP3Q8IVE0 287 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 UBE2E3Q969T4 207 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 FKBP10Q96AY3 582 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 NRTNQ99748 197 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 NUMA1Q14980 2115 aa18.43■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TBC1D3BA6NDS4 549 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 MAN1A2O60476 641 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 DPM1O60762 260 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 IL3P08700 152 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 NR4A1P22736 598 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 KELP23276 732 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 FSHRP23945 695 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SCARB2Q14108 478 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 KLHL35Q6PF15 583 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 MMP21Q8N119 569 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 FAR1Q8WVX9 515 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 HERVK_113Q902F9 699 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SUSD6Q92537 303 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 RAD51AP1Q96B01 352 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SLC23A2Q9UGH3 650 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TPRKBQ9Y3C4 175 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 NDUFS2O75306 463 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PCCBP05166 539 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 RB1P06400 928 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 JUNDP17535 347 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SOAT1P35610 550 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 IL12RB1P42701 662 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PRIM2P49643 509 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 CNTN1Q12860 1018 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 NPRL3Q12980 569 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 NPTX1Q15818 432 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 LCTLQ6UWM7 567 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 AMZ2Q86W34 360 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 HEATR4Q86WZ0 1026 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 RNF130Q86XS8 419 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SMARCD2Q92925 531 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PREBQ9HCU5 417 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SCN3BQ9NY72 215 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 NDUFAF4Q9P032 175 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 EPHX1P07099 455 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 MAP2K4P45985 399 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 RPP38P78345 283 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 FAM124AQ86V42 546 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 CACUL1Q86Y37 369 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 KRT78Q8N1N4 520 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 OXR1Q8N573 874 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 COX14Q96I36 57 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 RHNO1Q9BSD3 238 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 RASSF1Q9NS23 344 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 ENPP5Q9UJA9 477 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 A0A1W2PRB8 838 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 DNAJB5O75953 348 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 SLC35A2P78381 396 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 AQP6Q13520 282 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 CYP2A13Q16696 494 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 DSG4Q86SJ6 1040 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 FAM129CQ86XR2 697 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 UBE2FQ969M7 185 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TAMM41Q96BW9 452 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 DUSP21Q9H596 190 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TM7SF3Q9NS93 570 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 TAS2R9Q9NYW1 312 aa18.41■□□□□ 0.54
USP21-201ENST00000289865 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms