RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 GRHL2Q6ISB3 625 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 ACMSDQ8TDX5 336 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 MS4A6EQ96DS6 147 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 SMIM10Q96HG1 83 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 OR1F2PQ96R84 312 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 IPPKQ9H8X2 491 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 PPCSQ9HAB8 311 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 ZNF160Q9HCG1 818 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa23.74■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 A0A088AWK7 358 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 E2F3O00716 465 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 STX16O14662 325 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 PCDH17O14917 1159 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 DNAJB6O75190 326 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 HPP00738 406 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 PLA2G16P53816 162 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 PCDH1Q08174 1060 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 E2F2Q14209 437 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 MYBPC3Q14896 1274 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 TRIM40Q6P9F5 258 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 LCA5Q86VQ0 697 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 ATP6V1E2Q96A05 226 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 TBC1D20Q96BZ9 403 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 TMEM216Q9P0N5 145 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 MED13Q9UHV7 2174 aa23.73■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 OR2W5A6NFC9 320 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 SLC28A2O43868 658 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 ALPPP05187 535 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 FHP07954 510 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 COX6A1P12074 109 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 KRT15P19012 456 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 TAC1P20366 129 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 JAK1P23458 1154 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 EFNA3P52797 238 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 TGM3Q08188 693 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 LIPJQ5W064 366 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 WDR93Q6P2C0 686 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 NDUFAF7Q7L592 441 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 LAS2Q8IYD9 372 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 TEX19Q8NA77 164 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 OR2L5Q8NG80 312 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 OR7G3Q8NG95 312 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 MZB1Q8WU39 189 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 F2RL3Q96RI0 385 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 A0A1W2PPM1 405 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 KLHL41O60662 606 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 CYC1P08574 325 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 SERPINB1P30740 379 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 CCNG1P51959 295 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 KLRB1Q12918 225 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 COLEC12Q5KU26 742 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 TMEM205Q6UW68 189 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 PCTPQ9UKL6 214 aa23.71■■□□□ 1.39
PDF-201ENST00000288022 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 A8MT66 165 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 FOXO6A8MYZ6 492 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 B4GALT2O60909 372 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 SH3BGRLO75368 114 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 GSTA1P08263 222 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 SBK3P0C264 359 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 SOX8P57073 446 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 ADPRMQ3LIE5 342 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 EMBQ6PCB8 327 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 LANCL3Q6ZV70 420 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 TDRPQ86YL5 185 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 CA13Q8N1Q1 262 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 MS4A8Q9BY19 250 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 LANCL2Q9NS86 450 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 RIC8BQ9NVN3 520 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 ADGRE2Q9UHX3 823 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 ANAPC2Q9UJX6 822 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 KALRNO60229 2985 aa23.7■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa23.69■■□□□ 1.38
PDF-201ENST00000288022 TLDC2A0PJX2 215 aa23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms