RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 OR9A1PQ8NGU1 263 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 APH1BQ8WW43 257 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 TCF25Q9BQ70 676 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 HMG20AQ9NP66 347 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 FBXO8Q9NRD0 319 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 GPATCH2Q9NW75 528 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 PIPSLA2A3N6 862 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 CLDN24A6NM45 220 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 PDHA2P29803 388 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 SF1Q15637 639 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 IFI44LQ53G44 452 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 COMMD6Q7Z4G1 85 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 NAGSQ8N159 534 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ZNF540Q8NDQ6 660 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 SORCS1Q8WY21 1168 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 FOXJ1Q92949 421 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 UBE2E3Q969T4 207 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 TPD52L3Q96J77 140 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 DPEP2Q9H4A9 486 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 EPS8L2Q9H6S3 715 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 FKBP14Q9NWM8 211 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 NDUFAF4Q9P032 175 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa24.04■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 OR2A25A4D2G3 310 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 PRNPP04156 253 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 POU2F2P09086 479 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ANXA8P13928 327 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 RRM2P31350 389 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 GGT2P36268 569 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 OPRL1P41146 370 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 PHEXP78562 749 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 GPR153Q6NV75 609 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 UNC5DQ6UXZ4 953 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ARMCX6Q7L4S7 300 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ENTHD1Q8IYW4 607 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 MYLIPQ8WY64 445 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 PPP1R16AQ96I34 528 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 EYSQ5T1H1 3165 aa24.03■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ITGB7P26010 798 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 DPTQ07507 201 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 GRIN2CQ14957 1233 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 CRB2Q5IJ48 1285 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 IGFN1Q86VF2 1251 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 CENPSQ8N2Z9 138 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 SLC5A11Q8WWX8 675 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 POFUT2Q9Y2G5 429 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 RFXAPO00287 272 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 PCDHGA12O60330 932 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ITGA2P17301 1181 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 EPHA2P29317 976 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 SERPINB10P48595 397 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ERVFC1P60507 584 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 HBA1P69905 142 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ELP6Q0PNE2 266 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 DGUOKQ16854 277 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 RGS21Q2M5E4 152 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 ADPRMQ3LIE5 342 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 NXPE4Q6UWF7 544 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 Q7L0L9 218 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 GPR156Q8NFN8 814 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 C16orf78Q8WTQ4 265 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 C1GALT1Q9NS00 363 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 FAM8A1Q9UBU6 413 aa24.02■■□□□ 1.44
ROM1-201ENST00000278833 MAP2K4P45985 399 aa24.01■■□□□ 1.43
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ROM1-201ENST00000278833 IL1RL1Q01638 556 aa24.01■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
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ROM1-201ENST00000278833 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.01■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 TMIEQ8NEW7 156 aa24.01■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 PPCDCQ96CD2 204 aa24.01■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 SLC35A5Q9BS91 424 aa24.01■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 GPR34Q9UPC5 381 aa24.01■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 ICKQ9UPZ9 632 aa24.01■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 ARRDC5A6NEK1 342 aa24■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 TNFRSF11BO00300 401 aa24■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 AXIN1O15169 862 aa24■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 TBX19O60806 448 aa24■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 KLHL18O94889 574 aa24■■□□□ 1.43
ROM1-201ENST00000278833 IDUAP35475 653 aa24■■□□□ 1.43
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