RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CD200R1Q8TD46 325 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM80Q96HE8 168 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MYH4Q9Y623 1939 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GON4LQ3T8J9 2241 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TEX28O15482 410 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 KRT33AO76009 404 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SLC10A3P09131 477 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SPINT3P49223 89 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CNTN4Q8IWV2 1026 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GATA6Q92908 595 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MMP27Q9H306 513 aa16.98■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM150CB9EJG8 249 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RHOP08100 348 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PSKH1P11801 424 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MYF6P23409 242 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ARL9Q6T311 187 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PAMR1Q6UXH9 720 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ATCAYQ86WG3 371 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CITED4Q96RK1 184 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CDRT1O95170 752 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ACSL1P33121 698 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GJA5P36382 358 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CLCN7P51798 805 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 XKR4Q5GH76 650 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 WDR45Q9Y484 360 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 URB1O60287 2271 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PRAMEF10O60809 474 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF3P17036 446 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GM2AP17900 193 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ACADLP28330 430 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PIGFQ07326 219 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF534Q76KX8 674 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 NR4A3Q92570 626 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM45AQ9NWC5 275 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ANXA2P2A6NMY6 339 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SOCS7O14512 581 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 IL12BP29460 328 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CENPSQ8N2Z9 138 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PJA1Q8NG27 643 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ELOA3Q8NG57 546 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.97■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 IL3P08700 152 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FOXA1P55317 472 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 NPRL3Q12980 569 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PAGE3Q5JUK9 113 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TSPAN33Q86UF1 283 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ZSWIM3Q96MP5 696 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CD180Q99467 661 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 GPER1Q99527 375 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 DSN1Q9H410 356 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM181Q9P2C4 612 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MBD2Q9UBB5 411 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CDH7Q9ULB5 785 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PDCD5O14737 125 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 KCNA5P22460 613 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 CBLBQ13191 982 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TRAM2Q15035 370 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FIBINQ8TAL6 211 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM165Q9HC07 324 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 IL26Q9NPH9 171 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ERVK-18Q9QC07 812 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 FAM25EA8MYX2 175 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 MT-ND2P03891 347 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 RPS17P08708 135 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 AHCYP23526 432 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 DNASE1L1P49184 302 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 TBPL1P62380 186 aa16.96■□□□□ 0.31
SCARB2-201ENST00000264896 PITPNAQ00169 270 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms