RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SSR2P43308 183 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 E2F1Q01094 437 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM40Q6P9F5 258 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 NETO1Q8TDF5 533 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ERP27Q96DN0 273 aa24.81■■□□□ 1.56
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TOMM40-201ENST00000252487 TSSK3Q96PN8 268 aa24.81■■□□□ 1.56
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TOMM40-201ENST00000252487 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 GPR45Q9Y5Y3 372 aa24.81■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 H3BMH7 237 aa24.8■■□□□ 1.56
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TOMM40-201ENST00000252487 IL1RNP18510 177 aa24.8■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 BTN3A2P78410 334 aa24.8■■□□□ 1.56
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TOMM40-201ENST00000252487 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa24.8■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 FITM2Q8N6M3 262 aa24.8■■□□□ 1.56
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TOMM40-201ENST00000252487 GAL3ST3Q96A11 431 aa24.8■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 EGLN2Q96KS0 407 aa24.8■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 C10orf90Q96M02 699 aa24.8■■□□□ 1.56
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TOMM40-201ENST00000252487 ZNF860A6NHJ4 632 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 DCTN3O75935 186 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 FTH1P19P0C7X4 201 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CERS1P27544 350 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 OR4C11Q6IEV9 310 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 LRRC37BQ96QE4 947 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 NLNQ9BYT8 704 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 AHSPQ9NZD4 102 aa24.79■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 EFCAB7A8K855 629 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TM4SF5O14894 197 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 DNAJB6O75190 326 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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TOMM40-201ENST00000252487 PAOXQ6QHF9 649 aa24.78■■□□□ 1.56
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TOMM40-201ENST00000252487 ACTL8Q9H568 366 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 APMAPQ9HDC9 416 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TMED5Q9Y3A6 229 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ARHGAP10A1A4S6 786 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TMPRSS11DO60235 418 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC22O60826 627 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 MYO1DO94832 1006 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 LRATO95237 230 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SMIM10L1P0DMW3 83 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CCL4P13236 92 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 IDO1P14902 403 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 UFM1P61960 85 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 OLR1P78380 273 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SMU1Q2TAY7 513 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 HES3Q5TGS1 186 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CLNKQ7Z7G1 428 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 NUDT13Q86X67 352 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TREML1Q86YW5 311 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SMIM10Q96HG1 83 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM74Q96NL1 305 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 QRFPRQ96P65 431 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ASIC5Q9NY37 505 aa24.78■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 HYKKA2RU49 373 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 PMS2P1A4D2B8 440 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ALOX12P18054 663 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ITGA1P56199 1179 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 SQLEQ14534 574 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 RPS6KA2Q15349 733 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 TCTE1Q5JU00 501 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 GALNT18Q6P9A2 607 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 ACOT4Q8N9L9 421 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 CTRCQ99895 268 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 BRINP2Q9C0B6 783 aa24.77■■□□□ 1.56
TOMM40-201ENST00000252487 A0A0A6YYD5 115 aa24.76■■□□□ 1.55
TOMM40-201ENST00000252487 CSO75390 466 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TOMM40-201ENST00000252487 MT-CO3P00414 261 aa24.76■■□□□ 1.55
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