RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623333.1

AP000997.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AP000997.3, Length 2,250 nt, Biotype TEC.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF404Q494X3 552 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 LETMD1Q6P1Q0 360 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CYP4Z1Q86W10 505 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 ASB11Q8WXH4 323 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CD244Q9BZW8 370 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 IPPKQ9H8X2 491 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 RDH14Q9HBH5 336 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 OR2A25A4D2G3 310 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 KRT87PA6NCN2 255 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 MID1O15344 667 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 IGFBP5P24593 272 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 DRD3P35462 400 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CLK3P49761 638 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 PLIN5Q00G26 463 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 HTR4Q13639 388 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 TMEM52BQ4KMG9 183 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 COLEC12Q5KU26 742 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 RAET1GQ6H3X3 334 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 TMEM220Q6QAJ8 160 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 MTSS1LQ765P7 747 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 ASZ1Q8WWH4 475 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 GTF2H4Q92759 462 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 DCSTAMPQ9H295 470 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 ARL15Q9NXU5 204 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 AASSQ9UDR5 926 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 A3GALT2U3KPV4 340 aa17.73■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 KPNA5O15131 536 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 FADS2O95864 444 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CD36P16671 472 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 GPR1P46091 355 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 VAC14Q08AM6 782 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 ENPP2Q13822 863 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 C2orf27AQ580R0 203 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 FAM46CQ5VWP2 391 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 DESI1Q6ICB0 168 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 MSRB3Q8IXL7 192 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 MICU2Q8IYU8 434 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SMRP1Q8NCR6 262 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CXorf40AQ8TE69 158 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC13A3Q8WWT9 602 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SIGLEC11Q96RL6 698 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 KRT75O95678 551 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SEPHS1P49903 392 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 HTR6P50406 440 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CST6Q15828 149 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 OR4F6Q8NGB9 312 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 TBC1D20Q96BZ9 403 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 RHNO1Q9BSD3 238 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC12A9Q9BXP2 914 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 VNN3Q9NY84 501 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 U3KQV3 271 aa17.72■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 H3BQ06 376 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 NDUFB5O43674 189 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 ATG13O75143 517 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CREG1O75629 220 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 ANXA5P08758 320 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 PREPP48147 710 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CPZQ66K79 652 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 PNCKQ6P2M8 343 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 GALNT5Q7Z7M9 940 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF540Q8NDQ6 660 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC38A4Q969I6 547 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 OR2AG1Q9H205 316 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 SERGEFQ9UGK8 458 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 AP3M1Q9Y2T2 418 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa17.71■□□□□ 0.43
AP000997.3-201ENST00000623333 CENPBD1B2RD01 187 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 C8GP07360 202 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 CAPN1P07384 714 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 MPC1LP0DKB6 136 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 IGFBP4P22692 258 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 PRLHRP49683 370 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 TAS2R38P59533 333 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 ABRQ12979 859 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 TRAF3Q13114 568 aa17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
AP000997.3-201ENST00000623333 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms