RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620055.4

CCL4L2-215, Transcript of C-C motif chemokine ligand 4 like 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL4L2, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL4L2-215	ENST00000620055	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DPP10	Q8N608	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055		B4DGG1	531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	B4GAT1	O43505	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	RAD1	O60671	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CLDN11	O75508	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	GRAP2	O75791	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TM7SF2	O76062	418 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SPARC	P09486	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ALPI	P09923	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC2A4	P14672	509 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CD82	P27701	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCR1	P32246	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	GABRB2	P47870	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KLRB1	Q12918	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	NME3	Q13232	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ELOC	Q15369	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MIDN	Q504T8	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ART4	Q93070	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055		A0A0A0MQY5	61 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055		E5RJQ4	531 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	CPNE6	O95741	557 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	UGT2B4	P06133	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	HEXA	P06865	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCL4L2-215	ENST00000620055	PAEP	P09466	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms