RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 VEZF1Q14119 521 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CARTPTQ16568 116 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PERM1Q5SV97 790 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MROH9Q5TGP6 573 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MFSD14CQ5VZR4 134 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PID1Q7Z2X4 250 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.37□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 ZIC5Q96T25 663 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 WDCPQ9H6R7 721 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FBRSQ9HAH7 460 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NDE1Q9NXR1 346 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NUP205Q92621 2012 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 A0A0U1RQK1 487 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF320A2RRD8 509 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 C9orf170A2RU37 121 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 INPPL1O15357 1258 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CYTIPO60759 359 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SNNO75324 88 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 VAMP5O95183 116 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ATE1O95260 518 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ONECUT2O95948 504 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CD52P31358 61 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CRATP43155 626 aa7.36□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.36□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TMEM135Q86UB9 458 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RNF170Q96K19 258 aa7.36□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 ZNF347Q96SE7 839 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CEP41Q9BYV8 373 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 DERL2Q9GZP9 239 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ING3Q9NXR8 418 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MID2Q9UJV3 735 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GABRQQ9UN88 632 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NEU3Q9UQ49 428 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ISPDA4D126 451 aa7.36□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 KCNK1O00180 336 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 B3GAT3O94766 335 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 BPGMP07738 259 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GABRB3P28472 473 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 THPOP40225 353 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FCGRTP55899 365 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RBX1P62877 108 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SREBF2Q12772 1141 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TRAF2Q12933 501 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 BNIP2Q12982 314 aa7.36□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 BNIP3Q12983 259 aa7.36□□□□□ -1.23
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