RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF227Q86WZ6 799 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 EID3Q8N140 333 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 SPC24Q8NBT2 197 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 MCUQ8NE86 351 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINB12Q96P63 405 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 PARVBQ9HBI1 364 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 PPT2Q9UMR5 302 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC16A5O15375 505 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 CHST10O43529 356 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP104O60308 925 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJB6O75190 326 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GALT4O96024 378 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT14P02533 472 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 ALOX12P18054 663 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 PTGER1P34995 402 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEA3P43357 314 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 RGS4P49798 205 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 MLF1P58340 268 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 SKP1P63208 163 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 OLR1P78380 273 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 TLE4Q04727 773 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 PWP1Q13610 501 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 PHKG1Q16816 387 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB134Q4QY38 66 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 QSOX2Q6ZRP7 698 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 PALM2Q8IXS6 379 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 NDNQ99608 321 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 HAUS8Q9BT25 410 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 COQ3Q9NZJ6 369 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-226ENST00000593200 HCFC1P51610 2035 aa9.65□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GTH9 108 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBC2A0A5B9 178 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TFECO14948 347 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 FANCGO15287 622 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1F1O43749 312 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PRMT3O60678 531 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 B4GALT2O60909 372 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT38O76015 456 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 IGFBP2P18065 325 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC25BP30305 580 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CXCR5P32302 372 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HLCSP50747 726 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CCR8P51685 355 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGA8P53708 1063 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 BTG2P78543 158 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 RGS1Q08116 209 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 DUPD1Q68J44 220 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC27Q6P3X3 843 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 ABHD13Q7L211 337 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CD163Q86VB7 1156 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP4X1Q8N118 509 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 OR56A3Q8NH54 315 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM57AQ8TBR7 257 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 NT5CQ8TCD5 201 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PYCR2Q96C36 320 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SNF8Q96H20 258 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4K3Q96R72 315 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.64□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa9.63□□□□□ -0.87
EFTUD2-226ENST00000593200 FCHO1O14526 889 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms