RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD11Q8NFV4 315 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CALML6Q8TD86 181 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OLFM1Q99784 485 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 VKORC1Q9BQB6 163 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ENKD1Q9H0I2 346 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SCN3AQ9NY46 2000 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1F1O43749 312 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 B4GALT2O60909 372 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN12O95859 305 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PYCR2Q96C36 320 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SDCCAG3Q96C92 435 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM167BQ9BTA0 163 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SARGQ9BW04 601 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PPT2Q9UMR5 302 aa24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PCNX1Q96RV3 2341 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 POLQO75417 2590 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRG2O14669 202 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ALOX12P18054 663 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 JAK1P23458 1154 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB561P49447 251 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS4P49798 205 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR8P51685 355 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA8P53708 1063 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MLF1P58340 268 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 BTG2P78543 158 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TLE4Q04727 773 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT3A1Q6NUS8 523 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PAQR3Q6TCH7 311 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH24Q86UP0 819 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4X1Q8N118 509 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO1HQ8N1T3 1032 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4K1Q8NGD4 311 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CHTF18Q8WVB6 975 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC10Q96LC7 697 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4K3Q96R72 315 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 HAUS8Q9BT25 410 aa24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK2AP1O14519 115 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC16A5O15375 505 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPIND1P05546 499 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN3P20807 821 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN2DP55273 166 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PWP1Q13610 501 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PALM2Q8IXS6 379 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.436e-6■■■■■ 47.7
CAPNS1-211ENST00000590874 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 LINGO1Q96FE5 620 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PTCHD1Q96NR3 888 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SPNS1Q9H2V7 528 aa24.01■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 C2CD3Q4AC94 2353 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBC2A0A5B9 178 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CTAGE15A4D2H0 777 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SAGE2PA6NJ88 616 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MAOAP21397 527 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRB3P28472 473 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPEREQ5SY80 951 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 QSOX2Q6ZRP7 698 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CTAGE6Q86UF2 777 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 OR56A3Q8NH54 315 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5CQ8TCD5 201 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SNF8Q96H20 258 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MCCC2Q9HCC0 563 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R13Q9NYV9 303 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NEU2Q9Y3R4 380 aa24■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HIVEP1P15822 2718 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC168Q8NDH2 2452 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2ADP20671 130 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 RFC3P40938 356 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MEOX1P50221 254 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HLCSP50747 726 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MARVELD2Q8N4S9 558 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM125Q96AQ2 219 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2AJQ99878 128 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 H2AFJQ9BTM1 129 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL15Q9NXU5 204 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HRH3Q9Y5N1 445 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TACC2O95359 2948 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GTH9 108 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 PRMT3O60678 531 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT38O76015 456 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS1Q08116 209 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-211ENST00000590874 DUPD1Q68J44 220 aa23.98■■□□□ 1.43
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