RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 M1APQ8TC57 530 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MAGED4Q96JG8 741 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 OR1F2PQ96R84 312 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 LPAR4Q99677 370 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 IKZF3Q9UKT9 509 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 AKAP9Q99996 3911 aa11.37□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 C4orf51C9J302 202 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SLC16A5O15375 505 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TTI1O43156 1089 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 OR1F1O43749 312 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 FHP07954 510 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MYBL2P10244 700 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CCND1P24385 295 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 IVDP26440 423 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 RGS4P49798 205 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 OR4D2P58180 307 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 HERC3Q15034 1050 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 UGT3A1Q6NUS8 523 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MTFR2Q6P444 385 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF227Q86WZ6 799 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CNTN4Q8IWV2 1026 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SLC5A8Q8N695 610 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 OR56A3Q8NH54 315 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SLCO2A1Q92959 643 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 NEIL2Q969S2 332 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D20Q96BZ9 403 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 OLFM1Q99784 485 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SARGQ9BW04 601 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ARL15Q9NXU5 204 aa11.36□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TACC2O95359 2948 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TRBC2A0A5B9 178 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CCDC188H7C350 402 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CHST10O43529 356 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 B4GALT2O60909 372 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A12O75746 678 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 AHSGP02765 367 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SERPIND1P05546 499 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SP1P08047 785 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 COX6B1P14854 86 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ALOX12P18054 663 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MAOAP21397 527 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PTGER4P35408 488 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 GRK3P35626 688 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CCR8P51685 355 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CASP6P55212 293 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 BTG2P78543 158 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SPPL2CQ8IUH8 684 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PALM2Q8IXS6 379 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 LGI4Q8N135 537 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MNS1Q8NEH6 495 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ELP5Q8TE02 316 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 FBXL8Q96CD0 374 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 SNF8Q96H20 258 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 LURAP1Q96LR2 239 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 PHF12Q96QT6 1004 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 HAUS8Q9BT25 410 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 AICDAQ9GZX7 198 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CDCP1Q9H5V8 836 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 CHST11Q9NPF2 352 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 LRFN1Q9P244 771 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 MEMO1Q9Y316 297 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.35□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.34□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CTIF-208ENST00000590422 NDC80O14777 642 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms