RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 POLG2Q9UHN1 485 aa11.04□□□□□ -0.64
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CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.01□□□□□ -0.65
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.01□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 G3V2L1 256 aa11.01□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SUPT7LO94864 414 aa11.01□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SERPINE1P05121 402 aa11.01□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 GRK2P25098 689 aa11.01□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
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