RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ASMTP46597 345 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSCP53634 463 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 NXPH1P58417 271 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 MYBPC3Q14896 1274 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR180Q86V85 440 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.45■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM8Q9BZR9 551 aa24.45■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM64A6NGJ6 449 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2AG2A6NM03 316 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 VEGFDO43915 354 aa24.44■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 CNPY1Q3B7I2 92 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM220Q6QAJ8 160 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 EID3Q8N140 333 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 OR8J2Q8NGG1 315 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP28Q8NHY6 868 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 SAP25Q8TEE9 199 aa24.44■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 DMTF1Q9Y222 760 aa24.44■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMKMTQ7Z624 323 aa24.43■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN14Q8NG11 270 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ARRDC3Q96B67 414 aa24.43■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF145Q96MT1 663 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 DPEP2Q9H4A9 486 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 EHD1Q9H4M9 534 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PREBQ9HCU5 417 aa24.43■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BM21 787 aa24.42■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 GTF2H3Q13889 308 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 DOC2AQ14183 400 aa24.42■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINA11Q86U17 422 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 IQCHQ86VS3 1027 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 DHRSXQ8N5I4 330 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10A6Q8NH74 314 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PYCR2Q96C36 320 aa24.42■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 ATG10Q9H0Y0 220 aa24.42■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCNE2Q9Y6J6 123 aa24.42■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 PHC1P78364 1004 aa24.42■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 BMP10O95393 424 aa24.41■■□□□ 1.5
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 APOLD1Q96LR9 279 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 EFCAB11Q9BUY7 163 aa24.41■■□□□ 1.5
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