RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CENPHQ9H3R5 247 aa24.8■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.8■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 TRPC4Q9UBN4 977 aa24.8■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 STK38LQ9Y2H1 464 aa24.8■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 H0YIV9 168 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 MYZAPP0CAP1 466 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 PRKAR1AP10644 381 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 PCNAP12004 261 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CPA3P15088 417 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 IL1RNP18510 177 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 PHEXP78562 749 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 HYAL2Q12891 473 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 ERV3-1Q14264 604 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 RBBP7Q16576 425 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 NKG7Q16617 165 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 PGM2Q96G03 612 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 TMEM237Q96Q45 408 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 YIPF2Q9BWQ6 316 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 ZBTB26Q9HCK0 441 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa24.79■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 LRIT2A6NDA9 550 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 VSTM2BA6NLU5 285 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 KLHL18O94889 574 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 PIK3CBP42338 1070 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CLCQ05315 142 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 TGM3Q08188 693 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 UNC50Q53HI1 259 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 MILR1Q7Z6M3 343 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 AMER3Q8N944 861 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 OR52B6Q8NGF0 335 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 GAL3ST3Q96A11 431 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 MIEF2Q96C03 454 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 FAR2Q96K12 515 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 C14orf105Q9NVL8 296 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CTSFQ9UBX1 484 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 RNF11Q9Y3C5 154 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CACNA1BQ00975 2339 aa24.78■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 A0A088AWK7 358 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CDC14CA4D256 554 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 MLYCDO95822 493 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 ITGB2P05107 769 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 SMIM10L1P0DMW3 83 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CDH13P55290 713 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 DNAJB13P59910 316 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 RHDQ02161 417 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 TRAF3Q13114 568 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 SSPNQ14714 243 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 ADPRMQ3LIE5 342 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 GGTA1PQ4G0N0 100 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 DEFB134Q4QY38 66 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 PRSS41Q7RTY9 318 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 RAB43Q86YS6 212 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 STT3BQ8TCJ2 826 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 THAP4Q8WY91 577 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 MS4A6EQ96DS6 147 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 SMIM10Q96HG1 83 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 IP6K3Q96PC2 410 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 TGIF2Q9GZN2 237 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 KLHL31Q9H511 634 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 OXSMQ9NWU1 459 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 LHX6Q9UPM6 363 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-209ENST00000566600 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SGK494L7N484 410 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SPAG7O75391 227 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ZGLP1P0C6A0 271 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ASPHQ12797 758 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CASP8Q14790 479 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TMEM35AQ53FP2 167 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TRIM40Q6P9F5 258 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CHSY3Q70JA7 882 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PDSS2Q86YH6 399 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ARMC2Q8NEN0 867 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 OR2L5Q8NG80 312 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TRPC4APQ8TEL6 797 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 NACC2Q96BF6 587 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CMTM7Q96FZ5 175 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SPSB2Q99619 263 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 POLHQ9Y253 713 aa24.76■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ACTL7BQ9Y614 415 aa24.76■■□□□ 1.55
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