RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560834.1

CTDSPL2-210, Transcript of CTD small phosphatase like 2, humanhuman

TSL 4

Gene CTDSPL2, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2-210ENST00000560834 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 C7orf26Q96N11 449 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 FRG2BQ96QU4 278 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 HBEGFQ99075 208 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 CMKLR1Q99788 373 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 CTRCQ99895 268 aa6.7□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.7□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 STARD5Q9NSY2 213 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 THAP1Q9NVV9 213 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 PISDQ9UG56 409 aa6.7□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.7□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.7□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SDK2Q58EX2 2172 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SERTM1A2A2V5 107 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 C9orf172C9J069 976 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 PIP5K1BO14986 540 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 NDUFB5O43674 189 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR2B3O76000 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SERPINA6P08185 405 aa6.69□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF28P17035 718 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SPINK2P20155 84 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ITGAXP20702 1163 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SERPINB3P29508 390 aa6.69□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 GABREP78334 506 aa6.69□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 FOXM1Q08050 763 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 IFT88Q13099 833 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 PWP1Q13610 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 IL11RAQ14626 422 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 TCTE1Q5JU00 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.69□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 MAVSQ7Z434 540 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 KCT2Q8NC54 265 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 TRPV3Q8NET8 790 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR2T11Q8NH01 316 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 OR8K5Q8NH50 307 aa6.69□□□□□ -1.34
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CTDSPL2-210ENST00000560834 METTL6Q8TCB7 284 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 UBE2E3Q969T4 207 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 REPS1Q96D71 796 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ITPKCQ96DU7 683 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 RNF31Q96EP0 1072 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 CITED4Q96RK1 184 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 DDA1Q9BW61 102 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ACPTQ9BZG2 426 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 KLHL31Q9H511 634 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 BRF2Q9HAW0 419 aa6.69□□□□□ -1.34
CTDSPL2-210ENST00000560834 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.69□□□□□ -1.34
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