RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555114.5

NEDD1-207, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 3

Gene NEDD1, Length 731 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-207ENST00000555114 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SERPINB12Q96P63 405 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 SGPP1Q9BX95 441 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 FBN2P35556 2912 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD1-207ENST00000555114 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 OR1F1O43749 312 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 PRMT3O60678 531 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 B4GALT2O60909 372 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 HAUS5O94927 633 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 PTGS2P35354 604 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 HSF1Q00613 529 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CDSNQ15517 529 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 DEFB134Q4QY38 66 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 TRIM58Q8NG06 486 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ATL1Q8WXF7 558 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 SARGQ9BW04 601 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 PDZD2O15018 2839 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 TRBC2A0A5B9 178 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 USP27XA6NNY8 438 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CHST10O43529 356 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 TPOP07202 933 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 NPPBP16860 134 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 HLCSP50747 726 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ITGA8P53708 1063 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 AP1S2P56377 157 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 MLF1P58340 268 aa14.51□□□□□ -0.09
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NEDD1-207ENST00000555114 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 DUPD1Q68J44 220 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.51□□□□□ -0.09
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NEDD1-207ENST00000555114 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 SHISA5Q8N114 240 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 GPATCH11Q8N954 259 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ASB5Q8WWX0 329 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 SNF8Q96H20 258 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ARL15Q9NXU5 204 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ASB1Q9Y576 335 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CACNA1CQ13936 2221 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 MEOX1P50221 254 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 OLR1P78380 273 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CSHL1Q14406 222 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 TMEM156Q8N614 296 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 NT5CQ8TCD5 201 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 LINGO1Q96FE5 620 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 NDNQ99608 321 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CCDC175P0C221 793 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CXCR5P32302 372 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 PTGER1P34995 402 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 AHRP35869 848 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 CLCN2P51788 898 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 KRTAP10-9P60411 292 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 IL2P60568 153 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 TESK1Q15569 626 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD1-207ENST00000555114 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.49□□□□□ -0.09
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