RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CBLL1	Q75N03	491 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TMBIM1	Q969X1	311 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TSSK3	Q96PN8	268 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM129B	Q96TA1	746 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ING2	Q9H160	280 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	F5	P12259	2224 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442		M0QX08	132 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	NOBOX	O60393	691 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKD3	O94806	890 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PGM3	O95394	542 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	APOD	P05090	189 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	NCK1	P16333	377 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ITPKA	P23677	461 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CTSC	P53634	463 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TEK	Q02763	1124 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TAP2	Q03519	686 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	RUNX3	Q13761	415 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PDE7A	Q13946	482 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	KEAP1	Q14145	624 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF234	Q14588	700 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	UGT8	Q16880	541 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	BROX	Q5VW32	411 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CEP68	Q76N32	757 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF786	Q8N393	782 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	METTL4	Q8N3J2	472 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ARL10	Q8N8L6	244 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF566	Q969W8	418 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	MED8	Q96G25	268 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442		C9JVG2	144 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442		E7EQ34	232 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	VILL	O15195	856 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAMDEC1	O15204	470 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TPST1	O60507	370 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	GUCY1B2	O75343	617 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	E2F6	O75461	281 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	SOD1	P00441	154 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINA1	P01009	418 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	FABP3	P05413	133 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ENG	P17813	658 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	FPR1	P21462	350 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PCGF2	P35227	344 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	NEK2	P51955	445 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	TMBIM6	P55061	237 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	PHC1	P78364	1004 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LETMD1-223	ENST00000550442	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.34	□□□□□ -0.59

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