RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 SUPT7LO94864 414 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 NSA2O95478 260 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 RECKO95980 971 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CD63P08962 238 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 PCNAP12004 261 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CPA3P15088 417 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 ALOX12P18054 663 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CCNG1P51959 295 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 RAB8AP61006 207 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 IL10RAQ13651 578 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 DSG2Q14126 1118 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CCDC63Q8NA47 563 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 TRPC4APQ8TEL6 797 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 SMC6Q96SB8 1091 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 NTMT1Q9BV86 223 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 SLC26A1Q9H2B4 701 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 TRPC4Q9UBN4 977 aa21.37■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 LAMA5O15230 3695 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 A0A1B0GTL3 188 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 LRIT2A6NDA9 550 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 VSTM2BA6NLU5 285 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 H0YIG0 161 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 UGDHO60701 494 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 KLHL18O94889 574 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CLDN9O95484 217 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 GSTM2P28161 218 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CLCQ05315 142 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CDC20Q12834 499 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 TRAF3Q13114 568 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 HERC3Q15034 1050 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 RBBP7Q16576 425 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 DEFB134Q4QY38 66 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 VWA2Q5GFL6 755 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 RNF175Q8N4F7 328 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 STT3BQ8TCJ2 826 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 LHX6Q9UPM6 363 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 PADI2Q9Y2J8 665 aa21.36■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 URADA6NGE7 173 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 C4orf51C9J302 202 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 FOLR3P41439 243 aa21.35■■□□□ 1.01
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BRF1-216ENST00000550208 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 ABHD13Q7L211 337 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CROCCP2Q86T23 111 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 PRSS58Q8IYP2 241 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 OR4F6Q8NGB9 312 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 OR2Y1Q8NGV0 311 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 RDH11Q8TC12 318 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 MS4A6EQ96DS6 147 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CCDC126Q96EE4 140 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 F2RL3Q96RI0 385 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 SPSB2Q99619 263 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 WDR54Q9H977 334 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 A0A0G2JN53 185 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 ZNF860A6NHJ4 632 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 H0YIV9 168 aa21.34■■□□□ 1.01
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BRF1-216ENST00000550208 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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BRF1-216ENST00000550208 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 DEFB109BQ30KR1 87 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 LAPTM4BQ86VI4 370 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 OR5T3Q8NGG3 340 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 HUS1BQ8NHY5 278 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 MIEF2Q96C03 454 aa21.34■■□□□ 1.01
BRF1-216ENST00000550208 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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