RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.15□□□□□ -0.94
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PTPRB-204ENST00000538708 OPN1SWP03999 348 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRB-204ENST00000538708 SRCP12931 536 aa9.14□□□□□ -0.95
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