RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533235.5

SLC43A3-223, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 5

Gene SLC43A3, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-223	ENST00000533235	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	CHST10	O43529	356 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	WDR47	O94967	919 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	ICAM2	P13598	275 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	EDN3	P14138	238 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	GDF5	P43026	501 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	GPX6	P59796	221 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	AP2B1	P63010	937 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	POU4F1	Q01851	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF33B	Q06732	778 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	RGS1	Q08116	209 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	TGFBI	Q15582	683 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	ABHD13	Q7L211	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	GPR22	Q99680	433 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	DERL2	Q9GZP9	239 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	DDAH2	O95865	285 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	FH	P07954	510 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	IL10	P22301	178 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	CASQ1	P31415	396 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	GMPR	P36959	345 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	GP5	P40197	560 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	HNF4A	P41235	474 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	HNMT	P50135	292 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	RAB8A	P61006	207 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	TRADD	Q15628	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	INA	Q16352	499 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	CDKL2	Q92772	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	NPAS2	Q99743	824 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	CPNE1	Q99829	537 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	KLHL31	Q9H511	634 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	OLAH	Q9NV23	265 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	TAPBP	O15533	448 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	MAN1A2	O60476	641 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	CD1D	P15813	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	JAK1	P23458	1154 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24	1e-5	■■□□□ 12.9
SLC43A3-223	ENST00000533235	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR4D1	Q15615	310 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	NSDHL	Q15738	373 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	EXT1	Q16394	746 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	BEST3	Q8N1M1	668 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	BCORP1	Q8N888	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	TRPV3	Q8NET8	790 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	SMIM10	Q96HG1	83 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	LPAR4	Q99677	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	MMP25	Q9NPA2	562 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235		A8MUI8	341 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	B4GALT2	O60909	372 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SLC43A3-223	ENST00000533235	FAM155B	O75949	473 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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