RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FZD4Q9ULV1 537 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SNX7Q9UNH6 387 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASF1AQ9Y294 204 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 A0A1W2PRB8 838 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRBC2A0A5B9 178 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DUXAA6NLW8 204 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 E7EQ34 232 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BCKDKO14874 412 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TPST1O60507 370 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RFPL2O75678 378 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KAT7O95251 611 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SNAP29O95721 258 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCNAP12004 261 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NCK1P16333 377 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EPCAMP16422 314 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CEBPBP17676 345 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCNA2P20248 432 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITPKAP23677 461 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ITGB8P26012 769 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPP2R1BP30154 601 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IFNGR2P38484 337 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERFP50548 548 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAB28P51157 221 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CTSCP53634 463 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WNT3P56703 355 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ISL1P61371 349 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TBPL1P62380 186 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 YPEL5P62699 121 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PHC1P78364 1004 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDK3Q00526 305 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OCA2Q04671 838 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C2orf80Q0P641 193 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GRIN2CQ14957 1233 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNLSQ5VYX0 342 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAHD1Q6P587 224 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPESP1Q6UW49 350 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NUDT13Q86X67 352 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VRK3Q8IV63 474 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 P3H2Q8IVL5 708 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FBXO30Q8TB52 745 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NETO1Q8TDF5 533 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GIPC3Q8TF64 312 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BORCS5Q969J3 196 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NEIL2Q969S2 332 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ISOC1Q96CN7 298 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NEURL3Q96EH8 262 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MPP4Q96JB8 637 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MUS81Q96NY9 551 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SMIM14Q96QK8 99 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NODALQ96S42 347 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PITX2Q99697 317 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BTBD2Q9BX70 525 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TEX12Q9BXU0 123 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TOR3AQ9H497 397 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ANKRD19PQ9H560 264 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 WDR26Q9H7D7 661 aa6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms