RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0J9YVX5	310 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FBP2	O00757	339 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF1B	P20333	461 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IGFBP4	P22692	258 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PIK3CB	P42338	1070 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TAF13	Q15543	124 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IER5L	Q5T953	404 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KCTD11	Q693B1	232 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	REEP3	Q6NUK4	255 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SCML4	Q8N228	414 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IL17F	Q96PD4	163 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GAL3ST1	Q99999	423 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LHPP	Q9H008	270 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	WDR26	Q9H7D7	661 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LAMP1	P11279	417 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ETFA	P13804	333 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DCT	P40126	519 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	APLP1	P51693	650 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CD83	Q01151	205 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	C6orf183	Q5T699	404 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ARL9	Q6T311	187 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC14A	Q86T13	490 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OAF	Q86UD1	273 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NETO1	Q8TDF5	533 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MGME1	Q9BQP7	344 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	INPP5K	Q9BT40	448 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RMI1	Q9H9A7	625 aa		7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FAM170B	A6NMN3	283 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AREL1	O15033	823 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ORC5	O43913	435 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ERVK-21	P61565	698 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RCAN2	Q14206	197 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RAB41	Q5JT25	222 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LIN54	Q6MZP7	749 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC15A4	Q8N697	577 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF675	Q8TD23	568 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GLYATL1	Q969I3	302 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	APIP	Q96GX9	242 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DOHH	Q9BU89	302 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AASS	Q9UDR5	926 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GJD2	Q9UKL4	321 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	IRAK3	Q9Y616	596 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFS4	O43181	175 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF10	O60809	474 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HPR	P00739	348 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CDK4	P11802	303 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AGXT	P21549	392 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MNDA	P41218	407 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KCNC4	Q03721	635 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC13A2	Q13183	592 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CLCA4	Q14CN2	919 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		7.77	□□□□□ -1.17

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