RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC6A13Q9NSD5 602 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNK6Q9Y257 313 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa12.32□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 ATG2BQ96BY7 2078 aa12.32□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF683Q8IZ20 524 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 C10orf53Q8N6V4 93 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF740Q8NDX6 193 aa12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 ADH1CP00326 375 aa12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 AMD1P17707 334 aa12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 RPL3P39023 403 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 SEC13P55735 322 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 OR14C36Q8NHC7 312 aa12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 FAM129BQ96TA1 746 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 SACM1LQ9NTJ5 587 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 ENOPH1Q9UHY7 261 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 AOAHP28039 575 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 BCAP31P51572 246 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 22
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RABGEF1-211ENST00000503687 C2orf27AQ580R0 203 aa12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 VN1R5Q7Z5H4 357 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa12.31□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 C14orf119Q9NWQ9 140 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 SSR3Q9UNL2 185 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 ERVW-1Q9UQF0 538 aa12.31□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 ACOX3O15254 700 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNKO75909 580 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 TUBA3CQ13748 450 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 IQCCQ4KMZ1 466 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 CNKSR3Q6P9H4 555 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM131AQ6UXB0 335 aa12.3□□□□□ -0.44
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