RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 CRKLP46109 303 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GRB14Q14449 540 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PSMD6Q15008 389 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RNF130Q86XS8 419 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 APCDD1Q8J025 514 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TSSK2Q96PF2 358 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PDRG1Q9NUG6 133 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.86□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 G3V2L1 256 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 MAGEB2O15479 319 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PPIP5K2O43314 1243 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 KIF5CO60282 957 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SNAP91O60641 907 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TBCAO75347 108 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GOT1P17174 413 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 NOVP48745 357 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ZNF146Q15072 292 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 UPP1Q16831 310 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 METTL23Q86XA0 190 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TOMM40LQ969M1 308 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 EDEM3Q9BZQ6 932 aa4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 NEDD4P46934 1319 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ACOD1A6NK06 481 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 MT-ND2P03891 347 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 CAPN2P17655 700 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 CTNNA2P26232 953 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 HOXC13P31276 330 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 GP5P40197 560 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 ZNF542PQ5EBM4 170 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TCEAL6Q6IPX3 200 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SUSD1Q6UWL2 747 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 BTNL8Q6UX41 500 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 TEX26Q8N6G2 289 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 Q8NFD4 153 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SPPL2AQ8TCT8 520 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 SATB2Q9UPW6 733 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 KLK4Q9Y5K2 254 aa4.84□□□□□ -1.63
USP34-216ENST00000487547 C5orf52A6NGY3 159 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 PRSS46E5RG02 174 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 E5RGE8 158 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 H3BMM5 538 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 INPP4BO15327 924 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 TNFSF12O43508 249 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 SCG2P13521 617 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 SOAT1P35610 550 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 CETN1Q12798 172 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 COX10Q12887 443 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 ZNF774Q6NX45 483 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 TRIM7Q9C029 511 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 NSG2Q9Y328 171 aa4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 A0A0B4J203 849 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 PGRMC2O15173 223 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 ECE2O60344 883 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 FAM58BPP0C7Q3 252 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 SP9P0CG40 484 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 ITIH1P19827 911 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 GCKRQ14397 625 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
USP34-216ENST00000487547 FAM46CQ5VWP2 391 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms