RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480058.5

PRPF4B-205, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF4B, Length 6,775 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-205ENST00000480058 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SULT1C2O00338 296 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 STK25O00506 426 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 B3GALT2O43825 422 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SH3BGRLO75368 114 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 MMP3P08254 477 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SELPP16109 830 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CELP19835 753 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 NPR2P20594 1047 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GABRR2P28476 465 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 OXTRP30559 389 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 HOXD13P35453 343 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 DIO3P55073 304 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PRKCDQ05655 676 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ARFRP1Q13795 201 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CARD16Q5EG05 197 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 NOXRED1Q6NXP6 359 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FUT10Q6P4F1 479 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ANKRD46Q86W74 232 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF227Q86WZ6 799 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TEX26Q8N6G2 289 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 COPS5Q92905 334 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 INPP5EQ9NRR6 644 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 NDOR1Q9UHB4 597 aa5.95□□□□□ -1.46
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PRPF4B-205ENST00000480058 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 WASH4PA8MWX3 477 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FAM25EA8MYX2 175 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 LATO43561 262 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CD1DP15813 335 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 CD52P31358 61 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.466e-22■■■■■ 58.3
PRPF4B-205ENST00000480058 CHRNA4P43681 627 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 SELPLGQ14242 412 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 GRK1Q15835 563 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PYROXD2Q8N2H3 581 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 Q8N402 240 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 OR2T33Q8NG76 320 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.95□□□□□ -1.46
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PRPF4B-205ENST00000480058 MROQ9BYG7 248 aa5.95□□□□□ -1.46
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PRPF4B-205ENST00000480058 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 MOXD2PA6NHM9 499 aa5.94□□□□□ -1.46
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PRPF4B-205ENST00000480058 NIPSNAP2O75323 286 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 JUPP14923 745 aa5.94□□□□□ -1.46
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PRPF4B-205ENST00000480058 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 PFKLP17858 780 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 DUSP4Q13115 394 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 UNC50Q53HI1 259 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 TCEANCQ8N8B7 351 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 OR7G2Q8NG99 324 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 ELP5Q8TE02 316 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 RAB7BQ96AH8 199 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF4B-205ENST00000480058 FBXL20Q96IG2 436 aa5.94□□□□□ -1.46
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