RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 CRABP2P29373 138 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 GDF5P43026 501 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 TLR1Q15399 786 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 FAAH2Q6GMR7 532 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 ISCA2Q86U28 154 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 SPATA6LQ8N4H0 392 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 TTLQ8NG68 377 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 HAS2Q92819 552 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 ASF1BQ9NVP2 202 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC189A1A4V9 331 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 FAM155BO75949 473 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 GNLYP22749 145 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 UQCRFS1P47985 274 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 KCNC1P48547 511 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 PCDH1Q08174 1060 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 DEFB134Q4QY38 66 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD37Q7Z713 158 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 TBC1D20Q96BZ9 403 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 C19orf60Q96EN9 201 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 AICDAQ9GZX7 198 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-215ENST00000478473 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa22.08■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ESPL1Q14674 2120 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CHST10O43529 356 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PRAMEF4O60810 478 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 FHP07954 510 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 DLG1Q12959 904 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 LANCL3Q6ZV70 420 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PEX11GQ96HA9 241 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ATOH8Q96SQ7 321 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 DNAJC11Q9NVH1 559 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 HMX2A2RU54 273 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 DNAJB6O75190 326 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 STK16O75716 305 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CBX6O95503 412 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CELA2AP08217 269 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ITGAMP11215 1152 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CASP2P42575 452 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 LINC00696Q6ZRV3 163 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NMRAL1Q9HBL8 299 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 WWOXQ9NZC7 414 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PTGFRNQ9P2B2 879 aa22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 POLEQ07864 2286 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CLEC3AO75596 197 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 WFS1O76024 890 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 SERPIND1P05546 499 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 EPORP19235 508 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 JAK1P23458 1154 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 TNFSF10P50591 281 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.128e-8■■■□□ 19.1
C9orf3-215ENST00000478473 TBCCQ15814 346 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 QSOX2Q6ZRP7 698 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 KRT78Q8N1N4 520 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 M1APQ8TC57 530 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 GAL3ST3Q96A11 431 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 RHBGQ9H310 441 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 KLHL31Q9H511 634 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.05■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 SCN2AQ99250 2005 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 LRIT2A6NDA9 550 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 OR2W5A6NFC9 320 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 C4orf51C9J302 202 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms