RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	NEDD4	P46934	1319 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0B4J203	849 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334		A4D1N5	150 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	OOEP	A6NGQ2	149 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	MLNR	O43193	412 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ECE2	O60344	883 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CEACAM4	O75871	244 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TGDS	O95455	350 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM49	P0CI25	452 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM49C	P0CI26	452 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	OR3A3	P47888	321 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CALCOCO2	Q13137	446 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	NFE2L1	Q14494	772 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	MEP1B	Q16820	701 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	DOK6	Q6PKX4	331 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	GBP6	Q6ZN66	633 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SMYD1	Q8NB12	490 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CASP10	Q92851	521 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	AGAP4	Q96P64	663 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ATG101	Q9BSB4	218 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	VPS18	Q9P253	973 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	GPR132	Q9UNW8	380 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SATB2	Q9UPW6	733 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ILVBL	A1L0T0	632 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334		G3V2L1	256 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SLC7A4	O43246	635 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	IDH3B	O43837	385 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM50B	P56557	158 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CETN1	Q12798	172 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	NFATC2	Q13469	925 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	C2CD6	Q53TS8	623 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	MACC1	Q6ZN28	852 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	METTL4	Q8N3J2	472 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TEX26	Q8N6G2	289 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334		Q8NBF4	154 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	PKP2	Q99959	881 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM206	Q9H813	350 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CACNA1F	O60840	1977 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334		E9PQ18	207 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SOCS3	O14543	225 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	STX6	O43752	255 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	LRCH4	O75427	683 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	AOC1	P19801	751 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ITIH1	P19827	911 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	C4BPB	P20851	252 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	CTNNA2	P26232	953 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	GIF	P27352	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SRD5A2	P31213	254 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	KRT2	P35908	639 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	PPA1	Q15181	289 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RBM39-231	ENST00000477334	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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