RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GNSP15586 552 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CETN2P41208 172 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 PEX5P50542 639 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CLCN4P51793 760 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 HERV-K104P63124 156 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 ZXDBP98169 803 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 MYBPC1Q00872 1141 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 BNC1Q01954 994 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 OPCMLQ14982 345 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF16Q5VV41 709 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM171BQ6P995 826 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 FJX1Q86VR8 437 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM99Q8N816 258 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF149Q8NC42 400 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 SCMH1Q96GD3 660 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RTP3Q9BQQ7 232 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC38A7Q9NVC3 462 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS54Q9P1Q0 977 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 TEKT2Q9UIF3 430 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 C4orf47A7E2U8 309 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT7O43581 403 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 GPRIN2O60269 458 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 TBX19O60806 448 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RRASP10301 218 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXB2P14652 356 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDX2P32119 198 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 OTX2P32243 289 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGER3P43115 390 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 GEMP55040 296 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RELQ04864 619 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 BNIPLQ7Z465 357 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 KMT5CQ86Y97 462 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 LRTM2Q8N967 370 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 GRHL3Q8TE85 626 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF583Q96ND8 569 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 UBAC1Q9BSL1 405 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 NACA2Q9H009 215 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 DPEP2Q9H4A9 486 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 MARCH7Q9H992 704 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 NMRK1Q9NWW6 199 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RAI14Q9P0K7 980 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SGK1O00141 431 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL41O60662 606 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOBTB1O94844 696 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 MFN2O95140 757 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ASNSP08243 561 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 HMBSP08397 361 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 CLUP10909 449 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ODC1P11926 461 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PRF1P14222 555 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ANPEPP15144 967 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGB6P18564 788 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 DRD5P21918 477 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GJB2P29033 226 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPN4P29074 926 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 GDI1P31150 447 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 B3GALT5-AS1P59052 145 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2HP62256 183 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 FUT7Q11130 342 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 LCE3BQ5TA77 95 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-209ENST00000473406 RHBDF2Q6PJF5 856 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms