RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 TXLNGQ9NUQ3 528 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 STK38LQ9Y2H1 464 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RAD1O60671 282 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM13O60858 407 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CLDN9O95484 217 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V1G2O95670 118 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MLYCDO95822 493 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 OTCP00480 354 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35G6P0C7Q6 338 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LIPCP11150 499 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GCGRP47871 477 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CDH13P55290 713 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RGS1Q08116 209 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PCLAFQ15004 111 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RBBP7Q16576 425 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFA9Q16795 377 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MUM1Q2TAK8 710 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP157Q5JU67 520 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MILR1Q7Z6M3 343 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 DTX1Q86Y01 620 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf107Q8IVU9 208 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNYL1Q8N7R7 359 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 L3MBTL4Q8NA19 623 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GALNT6Q8NCL4 622 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NT5CQ8TCD5 201 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PADI1Q9ULC6 663 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP73A6NFT4 308 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKDD1BA6NHY2 528 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MEN1O00255 615 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 DSCR3O14972 297 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CD22P20273 847 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 AGXTP21549 392 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPINB1P30740 379 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ALDH3A1P30838 453 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RORAP35398 523 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ETV4P43268 484 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC18A1P54219 525 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NAGLUP54802 743 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HKDC1Q2TB90 917 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LAS2Q8IYD9 372 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 DSELQ8IZU8 1212 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC38A9Q8NBW4 561 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPC4APQ8TEL6 797 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 REPS1Q96D71 796 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RHBGQ9H310 441 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GX78 115 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 URADA6NGE7 173 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 J3QKU1 62 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 P2RX6O15547 441 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFS4O43181 175 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC3AO75596 197 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPIND1P05546 499 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 BPGMP07738 259 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPINA6P08185 405 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 IMPDH2P12268 514 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 ALAS2P22557 587 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 HPDP32754 393 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 ABHD18Q0P651 414 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 LCP2Q13094 533 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAF3Q13114 568 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM53BQ14153 422 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 LY6DQ14210 128 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 TTLL10Q6ZVT0 673 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 81.8
RABGEF1-205ENST00000450873 OR52B6Q8NGF0 335 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 NKD1Q969G9 470 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF382Q96SR6 550 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA4CQ9C0C4 833 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 LHX9Q9NQ69 397 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 NDOR1Q9UHB4 597 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC14AQ9UNH5 594 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF11Q9Y3C5 154 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 B8ZZF3 427 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 H0YIV9 168 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 BIRC5O15392 142 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPINB4P48594 390 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 PKNOX1P55347 436 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP4F2P78329 520 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 DCDP81605 110 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms