RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 ABHD13Q7L211 337 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 NDUFAF7Q7L592 441 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 IFT20Q8IY31 132 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SNX31Q8N9S9 440 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 TTLQ8NG68 377 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CREB3L4Q8TEY5 395 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 ESAMQ96AP7 390 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 NXNL1Q96CM4 212 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC6A16Q9GZN6 736 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 VN1R1Q9GZP7 353 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF160Q9HCG1 818 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 COPG2Q9UBF2 871 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 LRBAP50851 2863 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A096LPK6 155 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 URADA6NGE7 173 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF860A6NHJ4 632 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 UBXN8O00124 270 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CLGNO14967 610 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPT3HO75486 399 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SERPINA6P08185 405 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 C8orf89P0DMQ9 161 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 IL10P22301 178 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 GSTM2P28161 218 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 TYK2P29597 1187 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CD97P48960 835 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 EFNA3P52797 238 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 IRF9Q00978 393 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 Q0VFX4 171 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 HYAL2Q12891 473 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 MINDY4Q4G0A6 757 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 FAAH2Q6GMR7 532 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM205Q6UW68 189 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 IGFL3Q6UXB1 125 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 TAOK1Q7L7X3 1001 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PARP9Q8IXQ6 854 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 KRT78Q8N1N4 520 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 RHEBL1Q8TAI7 183 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 UBTD2Q8WUN7 234 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 TM9SF4Q92544 642 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR34Q96EX3 536 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SEC16BQ96JE7 1060 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 OR1F2PQ96R84 312 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PAFAH2Q99487 392 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CD244Q9BZW8 370 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 LHPPQ9H008 270 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 NT5DC2Q9H857 520 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 NFU1Q9UMS0 254 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 ASB1Q9Y576 335 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 IKBKGQ9Y6K9 419 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SYCE1LA8MT33 242 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PRAMEF4O60810 478 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 KLHL2O95198 593 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 RHOXF2BP0C7M4 288 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF224P0DH78 156 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 MTHFD2P13995 350 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 MAGEA12P43365 314 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 GLRBP48167 497 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SERPINB9P50453 376 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 ACAP2Q15057 778 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 MFSD4BQ5TF39 518 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC6A19Q695T7 634 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 KLC3Q6P597 504 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 KBTBD2Q8IY47 623 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SHISA5Q8N114 240 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 OR5T3Q8NGG3 340 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 ISL2Q96A47 359 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 AGAP4Q96P64 663 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 RHOXF2Q9BQY4 288 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms