RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 OR6P1Q8NGX9 317 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC20Q8TCA0 184 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 NETO1Q8TDF5 533 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 NUDT8Q8WV74 236 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 VPS4AQ9UN37 437 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.24■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM77I1YAP6 450 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 RAMP2O60895 175 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 KERAO60938 352 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 CYP7B1O75881 506 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 OR7A10O76100 309 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 CDK1P06493 297 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 HLA-DMAP28067 261 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 HYAL2Q12891 473 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 YIPF7Q8N8F6 280 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC120Q96HB5 630 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 FRMD6Q96NE9 622 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 GDE1Q9NZC3 331 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 J3KR12 359 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 GNPDA1P46926 289 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 OLR1P78380 273 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SCN1BQ07699 218 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SERINC3Q13530 473 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 GTF2H3Q13889 308 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 FBXO48Q5FWF7 155 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ATAT1Q5SQI0 421 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 OR2T5Q6IEZ7 315 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF549Q6P9A3 640 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 OR2T29Q8NH02 315 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ASB15Q8WXK1 588 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SMARCD2Q92925 531 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA1191Q96A73 305 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 MYADMQ96S97 322 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 GLTPQ9NZD2 209 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 RNF112Q9ULX5 631 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 WNT6Q9Y6F9 365 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 OR2B3O76000 313 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 C1QBP02746 253 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 PDGFAP04085 211 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF30P17039 623 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SLC19A1P41440 591 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SUOXP51687 545 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 MAPK12P53778 367 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 COL4A3Q01955 1670 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ASAH1Q13510 395 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA0040Q15053 153 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 MLIPQ5VWP3 458 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM25Q86YD3 366 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 OR7D4Q8NG98 312 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 KRT84Q9NSB2 600 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 V9GYH0 126 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 A0A1W2PQ09 198 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 B4DXG7 233 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 AKR7A2O43488 359 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 FPR1P21462 350 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 NPRL3Q12980 569 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 RBBP7Q16576 425 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 BTBD16Q32M84 506 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 MPPE1Q53F39 396 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 MPP7Q5T2T1 576 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 SMRP1Q8NCR6 262 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ASIC4Q96FT7 647 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 RNF121Q9H920 327 aa16.22■□□□□ 0.19
CNGA3-205ENST00000436404 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms