RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
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VARS-216ENST00000428445 PARVBQ9HBI1 364 aa15.52■□□□□ 0.08
VARS-216ENST00000428445 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
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VARS-216ENST00000428445 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.52■□□□□ 0.08
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VARS-216ENST00000428445 CEP97Q8IW35 865 aa15.51■□□□□ 0.07
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VARS-216ENST00000428445 GHDCQ8N2G8 530 aa15.5■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
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VARS-216ENST00000428445 KLHL31Q9H511 634 aa15.5■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 NECTIN3Q9NQS3 549 aa15.5■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 ZFHX3Q15911 3703 aa15.49■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 A0A1B0GTH9 108 aa15.49■□□□□ 0.07
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VARS-216ENST00000428445 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 ARL15Q9NXU5 204 aa15.49■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 PPT2Q9UMR5 302 aa15.49■□□□□ 0.07
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VARS-216ENST00000428445 SSTR2P30874 369 aa15.48■□□□□ 0.07
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VARS-216ENST00000428445 MEOX1P50221 254 aa15.48■□□□□ 0.07
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VARS-216ENST00000428445 MSS51Q4VC12 460 aa15.48■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.48■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 SULF2Q8IWU5 870 aa15.48■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.48■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.48■□□□□ 0.07
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VARS-216ENST00000428445 ANKRD53Q8N9V6 530 aa15.48■□□□□ 0.07
VARS-216ENST00000428445 OR56A3Q8NH54 315 aa15.48■□□□□ 0.07
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