RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D20Q96BZ9 403 aa12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDCCAG3Q96C92 435 aa12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGPP1Q9BX95 441 aa12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG10Q9H0Y0 220 aa12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPT2Q9UMR5 302 aa12.35□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB16A2A368 324 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDR42E2A6NKP2 422 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8GP07360 202 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGER1P34995 402 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYB561P49447 251 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SKP1P63208 163 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLR1P78380 273 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAE1Q13564 534 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF227Q86WZ6 799 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALML6Q8TD86 181 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB12Q96P63 405 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SARGQ9BW04 601 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOMER3Q9NSC5 361 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGSF5Q9NSI5 407 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COQ3Q9NZJ6 369 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAGE2PA6NJ88 616 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FANCGO15287 622 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAUS5O94927 633 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALOX12P18054 663 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS4P49798 205 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEOX1P50221 254 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA8P53708 1063 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLF1P58340 268 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PWP1Q13610 501 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB134Q4QY38 66 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT3A1Q6NUS8 523 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIPAL1Q6NVV3 410 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 QSOX2Q6ZRP7 698 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD163Q86VB7 1156 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PALM2Q8IXS6 379 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO1HQ8N1T3 1032 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POGLUT1Q8NBL1 392 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD11Q8NFV4 315 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM57AQ8TBR7 257 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM125Q96AQ2 219 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAUS8Q9BT25 410 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PARVBQ9HBI1 364 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO5Q9UKT4 447 aa12.34□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8MH3BSY2 632 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFECO14948 347 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC16A5O15375 505 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST10O43529 356 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1F1O43749 312 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP104O60308 925 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALT2O60909 372 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJB6O75190 326 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT14P02533 472 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPOP07202 933 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPPBP16860 134 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGS2P35354 604 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLCSP50747 726 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCR8P51685 355 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHKG1Q16816 387 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP4X1Q8N118 509 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPC24Q8NBT2 197 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCUQ8NE86 351 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTCHD1Q96NR3 888 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDNQ99608 321 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM167BQ9BTA0 163 aa12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NF1P21359 2839 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GTH9 108 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBC2A0A5B9 178 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCHO1O14526 889 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRMT3O60678 531 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GALT4O96024 378 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPIND1P05546 499 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGFBP2P18065 325 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H2ADP20671 130 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC25BP30305 580 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEA3P43357 314 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS1Q08116 209 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC27Q6P3X3 843 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD13Q7L211 337 aa12.32□□□□□ -0.44
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STRA8Q7Z7C7 330 aa12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms