RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 DOK6Q6PKX4 331 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AHSA2Q719I0 299 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM129CQ86XR2 697 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX6Q9UNH7 406 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AUP1Q9Y679 476 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM77I1YAP6 450 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH17O14917 1159 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT2B17O75795 530 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VIPP01282 170 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EPB42P16452 691 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSCP53634 463 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TAP2Q03519 686 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TEAD4Q15561 434 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PAQR6Q6TCH4 344 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7G3Q8NG95 312 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO32Q969P5 355 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HHIPL1Q96JK4 782 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SGPP1Q9BX95 441 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KCMF1Q9P0J7 381 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SRRDQ9UH36 339 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM186AA6NE01 2351 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 WASH3PC4AMC7 463 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BM21 787 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 J3QRE1 110 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 STX7O15400 261 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HS6ST1O60243 411 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 STSP08842 583 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-FP30511 346 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BTCP35070 178 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLIN5Q00G26 463 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPY1Q01534 308 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP4Q13115 394 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DGCR6Q14129 220 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR153Q6NV75 609 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BHLHB9Q6PI77 547 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MILR1Q7Z6M3 343 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D19Q8N5T2 526 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SYT14Q8NB59 555 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BEGAINQ9BUH8 593 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
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PGGT1B-203ENST00000419445 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARAFP10398 606 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CD79BP40259 229 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENOWP63302 87 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ST3GAL4Q11206 333 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LYPD8Q6UX82 237 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 POGLUT1Q8NBL1 392 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 Q96MT0 163 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ATAD3AQ9NVI7 634 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HCN2Q9UL51 889 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM227AF5H4B4 570 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SOCS5O75159 536 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFS3O75489 264 aa3.47□□□□□ -1.85
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PGGT1B-203ENST00000419445 CYP4B1P13584 511 aa3.47□□□□□ -1.85
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PGGT1B-203ENST00000419445 TNFSF8P32971 234 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AP1S2P56377 157 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXC5Q00444 222 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DUOXA1Q1HG43 343 aa3.47□□□□□ -1.85
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PGGT1B-203ENST00000419445 TMC8Q8IU68 726 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RBFAQ8N0V3 343 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB2Q8N680 514 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF740Q8NDX6 193 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VN1R2Q8NFZ6 395 aa3.47□□□□□ -1.85
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PGGT1B-203ENST00000419445 RORBQ92753 470 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DOHHQ9BU89 302 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPAQ9BY32 194 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NACA2Q9H009 215 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.47□□□□□ -1.85
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