RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 TMCO6Q96DC7 493 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 AIG1Q9NVV5 245 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP98P52948 1817 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A096LPI6 279 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ACOX3O15254 700 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TGM5O43548 720 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF12P17014 697 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GJA5P36382 358 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 DECR1Q16698 335 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP40Q5TG30 622 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ATG9BQ674R7 924 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SCD5Q86SK9 330 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SMARCD2Q92925 531 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 BADQ92934 168 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MED28Q9H204 178 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM172BPA6NC97 362 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 VEGFDO43915 354 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 DFNA5O60443 496 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 VLDLRP98155 873 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KBTBD6Q86V97 674 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF676Q8N7Q3 588 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 FATE1Q969F0 183 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MGME1Q9BQP7 344 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CH25HO95992 272 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 BMP8BP34820 402 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GFOD2Q3B7J2 385 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ITPAQ9BY32 194 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KAT7O95251 611 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 EDN1P05305 212 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TACSTD2P09758 323 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ARSFP54793 590 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4D1Q15615 310 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MEP1AQ16819 746 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS2R9Q9NYW1 312 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SOX14O95416 240 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 FUT4P22083 530 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 UQCRC2P22695 453 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXO43Q4G163 708 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MBD2Q9UBB5 411 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 H3BSA7 217 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 HSD3B1P14060 373 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 JUPP14923 745 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 HSD3B2P26439 372 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CD70P32970 193 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CD180Q99467 661 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 EPYCQ99645 322 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GAL3ST1Q99999 423 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SYT11Q9BT88 431 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 DCSTAMPQ9H295 470 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GIN1Q9NXP7 522 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNC4Q03721 635 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 EMC10Q5UCC4 262 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MLIPQ5VWP3 458 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LGR4Q9BXB1 951 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RHCGQ9UBD6 479 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 BPIP17213 487 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ID2Q02363 134 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 DEFB119Q8N690 84 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 FIBINQ8TAL6 211 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM203Q969S6 136 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SP140LQ9H930 580 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ASGR2P07307 311 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PHF19Q5T6S3 580 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TBPL1P62380 186 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MC1RQ01726 317 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4K14Q8NGD5 310 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms