RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 MED27Q6P2C8 311 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 EXTL1Q92935 676 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM237Q96Q45 408 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 RHBGQ9H310 441 aa22.61■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.61■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 UBE2E3Q969T4 207 aa22.6■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 CATSPER2Q96P56 530 aa22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.6■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 HCN3Q9P1Z3 774 aa22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CHD6Q8TD26 2715 aa22.6■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 LRIT2A6NDA9 550 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 URADA6NGE7 173 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 G3V2L1 256 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP6CO00743 305 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 UGDHO60701 494 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.59■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 PRKAA2P54646 552 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 RHDQ02161 417 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC22A9Q8IVM8 553 aa22.59■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC63Q8NA47 563 aa22.59■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 RNF175Q8N4F7 328 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UBE2E3-202ENST00000410062 MS4A6EQ96DS6 147 aa22.59■■□□□ 1.21
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UBE2E3-202ENST00000410062 ITGB2P05107 769 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 CREB1P16220 341 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 OLR1P78380 273 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 TRAF3Q13114 568 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 BORAQ6PGQ7 559 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 SMIM10Q96HG1 83 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 NTMT1Q9BV86 223 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 MKS1Q9NXB0 559 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 CACNA1GO43497 2377 aa22.58■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 ERI3O43414 337 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 SH3BGRLO75368 114 aa22.57■■□□□ 1.2
UBE2E3-202ENST00000410062 CLCQ05315 142 aa22.57■■□□□ 1.2
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