RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398417.6

SMAD4-202, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SMAD4, Length 8,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-202ENST00000398417 FAM92AA1XBS5 289 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CLPXO76031 633 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ALPLP05186 524 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 POU2F2P09086 479 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 EMP3P54852 163 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 DEFB103AP81534 67 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 MXD1Q05195 221 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 UGT8Q16880 541 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SPATS1Q496A3 300 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 UBE2J2Q8N2K1 259 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 UBTD2Q8WUN7 234 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 UBE2FQ969M7 185 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ACDQ96AP0 544 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 COPS4Q9BT78 406 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 C8orf4Q9NR00 106 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 KLHL3Q9UH77 587 aa4.76□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SLC16A5O15375 505 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 NUAK1O60285 661 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 APOA1P02647 267 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ZNF12P17014 697 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 PDHA2P29803 388 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CREMQ03060 361 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 HSPB3Q12988 150 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 NIPAL1Q6NVV3 410 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CASP12Q6UXS9 341 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 MACC1Q6ZN28 852 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 OLIG3Q7RTU3 272 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 KRT78Q8N1N4 520 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 KLHL31Q9H511 634 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 IL37Q9NZH6 218 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SESN1Q9Y6P5 492 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SMIM30A4D0T7 59 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 UPK1AO00322 258 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CBSLP0DN79 551 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 PTPN2P17706 415 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 AOAHP28039 575 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CBSP35520 551 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 RFX3P48380 749 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CDK6Q00534 326 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SMU1Q2TAY7 513 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 MAL2Q969L2 176 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 TIFAQ96CG3 184 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 IL21Q9HBE4 155 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 GIN1Q9NXP7 522 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 RNF6Q9Y252 685 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 KCNE2Q9Y6J6 123 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 GABRR3A8MPY1 467 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 TLR4O00206 839 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 TBX1O43435 398 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SLC28A2O43868 658 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 MMP20O60882 483 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 PCCBP05166 539 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 PCYT1AP49585 367 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 PMPCAQ10713 525 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 TUBA3CQ13748 450 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 RAB33AQ14088 237 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 CLCA4Q14CN2 919 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 GUK1Q16774 197 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 STARD8Q92502 1023 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 SLC46A2Q9BY10 475 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 RDH14Q9HBH5 336 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 ABCB9Q9NP78 766 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 TAC3Q9UHF0 121 aa4.75□□□□□ -1.65
SMAD4-202ENST00000398417 KLF15Q9UIH9 416 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms