RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384310.1

RNU6-339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-339P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-339P-201ENST00000384310 ASNSP08243 561 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 GSTA2P09210 222 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 SFTPCP11686 197 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 KRT3P12035 628 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CEACAM1P13688 526 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ANPEPP15144 967 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 RPA2P15927 270 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 TNFRSF1BP20333 461 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CYP3A5P20815 502 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ATP6V1C1P21283 382 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 GJB2P29033 226 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 GDI1P31150 447 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 PRDX2P32119 198 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 PEX5P50542 639 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZXDBP98169 803 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 RELQ04864 619 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 KEAP1Q14145 624 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 HLFQ16534 295 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 PDK4Q16654 411 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CCDC152Q4G0S7 254 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 GPAT3Q53EU6 434 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 C20orf194Q5TEA3 1177 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 FAM171BQ6P995 826 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ERASQ7Z444 233 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 PIP4P1Q86T03 277 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 TMEM219Q86XT9 240 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 KMT5CQ86Y97 462 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CDH26Q8IXH8 852 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 EID3Q8N140 333 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 FAM133AQ8N9E0 248 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 STKLD1Q8NE28 680 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 DDB2Q92466 427 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 RAB39BQ96DA2 213 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 NSL1Q96IY1 281 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CXorf58Q96LI9 332 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 GPR137Q96N19 417 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 BTBD9Q96Q07 612 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZNF607Q96SK3 696 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 RTP3Q9BQQ7 232 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 MARCH7Q9H992 704 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 LRRC40Q9H9A6 602 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 RNF186Q9NXI6 227 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 VPS54Q9P1Q0 977 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 VDAC3Q9Y277 283 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 A0A0G2JPF8 293 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 A0A1B0GUL7 405 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CTAGE15A4D2H0 777 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 TULP2O00295 520 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 SYT7O43581 403 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 GPRIN2O60269 458 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 TBX19O60806 448 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 UGT2B4P06133 528 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CA3P07451 260 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 YES1P07947 543 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CTAGE8P0CG41 777 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CLUP10909 449 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 TOP1P11387 765 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CD59P13987 128 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 PRF1P14222 555 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 HOXB2P14652 356 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 ITGB6P18564 788 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 DRD5P21918 477 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 LHCGRP22888 699 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 EPHA2P29317 976 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 OTX2P32243 289 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-339P-201ENST00000384310 CLCN4P51793 760 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms