RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384105.1

RNU6V-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear variant sequence with SNRPE pseudogene sequence, humanhuman

BASIC

Gene RNU6V, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6V-201ENST00000384105 FRMD3A2A2Y4 597 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PSMB11A5LHX3 300 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LRIT2A6NDA9 550 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IGLON5A6NGN9 336 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 YDJCA8MPS7 323 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 AGAP14A8MT82 685 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 A8MUA0 341 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 E7EVH7 732 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 F5H423 210 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 K7EM74 188 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CDC7O00311 574 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CLDN5O00501 218 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACKR2O00590 384 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ISLRO14498 428 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 VCYO14598 125 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CASKO14936 926 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PIP5K1BO14986 540 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SCAMP1O15126 338 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TEX28O15482 410 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ADAM20O43506 726 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SNAI2O43623 268 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TSPAN6O43657 245 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ASNA1O43681 348 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ADAP1O75689 374 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CBR3O75828 277 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NDUFB2O95178 105 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PARNO95453 639 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MLYCDO95822 493 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PGK1P00558 417 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TGFAP01135 160 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 IFNA10P01566 189 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MT2AP02795 61 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CRYGBP07316 175 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 QDPRP09417 244 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 P0C880 135 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DLATP10515 647 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MT1GP13640 62 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MMP9P14780 707 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ETS1P14921 441 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GLULP15104 373 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF250P15622 560 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CYP2B6P20813 491 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZP3P21754 424 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MUTP22033 750 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LMO2P25791 158 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 POU1F1P28069 291 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PTPN4P29074 926 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OAS2P29728 719 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ABCD1P33897 745 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SERPINF1P36955 418 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NNMTP40261 264 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GABRB2P47870 512 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 STK19P49842 368 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MEOX2P50222 304 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ATP4BP51164 291 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 VAMP7P51809 220 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CASP5P51878 434 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SMSP52788 366 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GALCP54803 685 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CCL23P55773 120 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TBX4P57082 545 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ASIC1P78348 528 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CTAG1AP78358 180 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BEX3Q00994 111 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SPIBQ01892 262 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OGDHQ02218 1023 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SP4Q02446 784 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GCNT1Q02742 428 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ENPEPQ07075 957 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MGAT3Q09327 533 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BLMHQ13867 455 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 VEZF1Q14119 521 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MORC3Q14149 939 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF146Q15072 292 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TAF11Q15544 211 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PTPN14Q15678 1187 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NAB2Q15742 525 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TAZQ16635 292 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ISXQ2M1V0 245 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NDUFAF6Q330K2 333 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NADK2Q4G0N4 442 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms