RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377327.8

CRNKL1-201, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CRNKL1, Length 4,370 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1-201ENST00000377327 GGT2P36268 569 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 NTRK2Q16620 822 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ZNF583Q96ND8 569 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 NELL2Q99435 816 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 MNTQ99583 582 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 IFT27Q9BW83 186 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 CTPS2Q9NRF8 586 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 A0A1W2PQ67 120 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TBL1XO60907 577 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 BEST1O76090 585 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 GSTM3P21266 225 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TGM1P22735 817 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 EVI2BP34910 448 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 DSTNP60981 165 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TUSC3Q13454 348 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 CPZQ66K79 652 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ARSKQ6UWY0 536 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SNX20Q7Z614 316 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 CEP76Q8TAP6 659 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ING5Q8WYH8 240 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 KAT2AQ92830 837 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TREX1Q9NSU2 369 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.76□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 PIRO00625 290 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 PRMT3O60678 531 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 PLATP00750 562 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ACVRL1P37023 503 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 HNMTP50135 292 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SERINC3Q13530 473 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 EFR3AQ14156 821 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 NDUFA9Q16795 377 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 OLFML2AQ68BL7 652 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ARL9Q6T311 187 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SLC7A6Q92536 515 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SLC9A6Q92581 669 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 COQ10AQ96MF6 247 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ZNF69Q9UC07 566 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 H3BM21 787 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 OR1I1O60431 355 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 GSRP00390 522 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 CAPNS1P04632 268 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 MNDAP41218 407 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 PIK3CBP42338 1070 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 CDH11P55287 796 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 FAM189BP81408 668 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 POU4F3Q15319 338 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 LINC00471Q8N535 108 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ATAD1Q8NBU5 361 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 GGHQ92820 318 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 PIP5K1AQ99755 562 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 RNF39Q9H2S5 420 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 NIPAL2Q9H841 368 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 GLTPQ9NZD2 209 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 SPACA6W5XKT8 324 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ZNF879B4DU55 563 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 PROM1O43490 865 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 ACSL4O60488 711 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 IFNGP01579 166 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 EDN1P05305 212 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.75□□□□□ -1.01
CRNKL1-201ENST00000377327 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms