RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 SCGB3A2Q96PL1 93 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PEX10O60683 326 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 HTR2AP28223 471 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MPIP34949 423 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCA11PQ4W5N1 156 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 BORCS6Q96GS4 357 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 BCO2Q9BYV7 579 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNH6Q9H252 994 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 OR51I1Q9H343 314 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 RABL2BQ9UNT1 228 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa18.01■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 J3KR12 359 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 RENP00797 406 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 HSD17B1P14061 328 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 AGTR2P50052 363 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SEMG2Q02383 582 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNC4Q03721 635 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 WDR45BQ5MNZ6 344 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 BORAQ6PGQ7 559 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 OR5T3Q8NGG3 340 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CD300LFQ8TDQ1 290 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 GAL3ST3Q96A11 431 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CMTM7Q96FZ5 175 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF599Q96NL3 588 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC72A6NJI9 287 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MMP3P08254 477 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 AHCYP23526 432 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 UBXN11Q5T124 520 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 LBX2Q6XYB7 198 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 KNDC1Q76NI1 1749 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 EEDO75530 441 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 UPK1BO75841 260 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 H2AFB2P0C5Z0 115 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 HFE2Q6ZVN8 426 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 KCTD9Q7L273 389 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 COMMD7Q86VX2 200 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR88Q9GZN0 384 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 KAT7O95251 611 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 RAB5BP61020 215 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 DESI1Q6ICB0 168 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 RIPOR3Q96MK2 946 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ACTR6Q9GZN1 396 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 AIG1Q9NVV5 245 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 TLR6Q9Y2C9 796 aa18■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 F5H0A9 414 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC35E2BP0CK96 405 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 GM2AP17900 193 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CD47Q08722 323 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 FGFBP1Q14512 234 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CGB2Q6NT52 195 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CYS1Q717R9 158 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR142Q7Z601 462 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SHKBP1Q8TBC3 707 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF382Q96SR6 550 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 CDH7Q9ULB5 785 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 IFT172Q9UG01 1749 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 BTBD19C9JJ37 291 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PON3Q15166 354 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 NTRK2Q16620 822 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD54Q6NXT1 300 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM129CQ86XR2 697 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 OR6C4Q8NGE1 309 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MGAT4CQ9UBM8 478 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXL3Q9UKT7 428 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PRMT3O60678 531 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 GADD45AP24522 165 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 KDELR2P33947 212 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PTCHD3Q3KNS1 767 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SHISA4Q96DD7 197 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 MYH10P35580 1976 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDH17O14917 1159 aa17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms