RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369547.5

SYT6-201, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT6, Length 4,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-201ENST00000369547 SCN1BQ07699 218 aa15.6■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 KCTD11Q693B1 232 aa15.6■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.6■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.6■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 REEP4Q9H6H4 257 aa15.6■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 DENRO43583 198 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MPZL2O60487 215 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CPOXP36551 454 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PPP2R2BQ00005 443 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ST3GAL4Q11206 333 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RETREG3Q86VR2 466 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 NETO1Q8TDF5 533 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MYRFLQ96LU7 910 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ACOX3O15254 700 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 AHCYP23526 432 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CST9Q5W186 159 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 HSDL2Q6YN16 418 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SLC22A12Q96S37 553 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 SATB2Q9UPW6 733 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 NME7Q9Y5B8 376 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 A0A1W2PP55 124 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CLDN4O14493 209 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MT-ND2P03891 347 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RLN1P04808 185 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 HSD17B1P14061 328 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 NFE2L1Q14494 772 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 AMZ1Q400G9 498 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 IDNKQ5T6J7 187 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PGBD5Q8N414 524 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 B3GALT2O43825 422 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MAGEA3P43357 314 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 KHKP50053 298 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PRMT2P55345 433 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TRPV1Q8NER1 839 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 FEVQ99581 238 aa15.59■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 A0A096LPI6 279 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 DAPL1A0PJW8 107 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 E7EQ34 232 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 PMS2P3Q13401 168 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 LRP8Q14114 963 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 ITPAQ9BY32 194 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 UCK2Q9BZX2 261 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 FAM118AQ9NWS6 357 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 MS4A12Q9NXJ0 267 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 TAS2R9Q9NYW1 312 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 KNTC1P50748 2209 aa15.58■□□□□ 0.09
SYT6-201ENST00000369547 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 PTGER1P34995 402 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 ATG9BQ674R7 924 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 REEP3Q6NUK4 255 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 RFKQ969G6 155 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 FAM129BQ96TA1 746 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 PRSS21Q9Y6M0 314 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 FCER2P06734 321 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 FGF4P08620 206 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 OR12D1P0DN82 309 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 CLDN8P56748 225 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 PPP2R2DQ66LE6 453 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 LCN8Q6JVE9 175 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 ARL9Q6T311 187 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 PIGKQ92643 395 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 C5orf34Q96MH7 638 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SYT6-201ENST00000369547 ADAM17P78536 824 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms