RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ITGA1P56199 1179 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 BNIP1Q12981 228 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 C3orf38Q5JPI3 329 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 TCTE1Q5JU00 501 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 CAMKVQ8NCB2 501 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 USP7Q93009 1102 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 CTRCQ99895 268 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 DMRT3Q9NQL9 472 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO8Q9NRD0 319 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 MRGBPQ9NV56 204 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 SPTBP11277 2137 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEB17A8MXT2 336 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 H3BMH7 237 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PLD2O14939 933 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 JMJD7P0C870 316 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PHEXP78562 749 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PWP1Q13610 501 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 IL11RAQ14626 422 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 ABRAXAS2Q15018 415 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 CYB5D1Q6P9G0 228 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 SCIMPQ6UWF3 145 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 GPR135Q8IZ08 494 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 TUBB6Q9BUF5 446 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 SLC39A1Q9NY26 324 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 SATB2Q9UPW6 733 aa28.18■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 KNTC1P50748 2209 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 VPS4BO75351 444 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 ETV5P41161 510 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 ID4P47928 161 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 RPS13P62277 151 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 KRT72Q14CN4 511 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 NT5CQ8TCD5 201 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 NLNQ9BYT8 704 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PISDQ9UG56 409 aa28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 SPTBN4Q9H254 2564 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 TGFB1P01137 390 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 MAPK10P53779 464 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 RGS1Q08116 209 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 HYAL2Q12891 473 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R3BQ86XI6 285 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 KCT2Q8NC54 265 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 OR8K5Q8NH50 307 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 MS4A8Q9BY19 250 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 TUBB1Q9H4B7 451 aa28.16■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8OA6NCC3 632 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8NF8WBI6 632 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 TXNDC9O14530 226 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 SH3BGRLO75368 114 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 ATP5HO75947 161 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 FGF5P12034 268 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PRTGQ2VWP7 1150 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC106Q9BWC9 280 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 SLC12A4Q9UP95 1085 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa28.15■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 CAPN14A8MX76 684 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PIP5K1BO14986 540 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF33BQ06732 778 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 FOXC1Q12948 553 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 GRM7Q14831 915 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.18e-10■■□□□ 13.3
ECHS1-201ENST00000368547 PMEPA1Q969W9 287 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 CMTM7Q96FZ5 175 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R36Q96LQ0 422 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 SLC6A16Q9GZN6 736 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 ENAMQ9NRM1 1142 aa28.14■■■□□ 2.1
ECHS1-201ENST00000368547 FITM1A5D6W6 292 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 LRIT2A6NDA9 550 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 E9PBE3 544 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 SLC22A2O15244 555 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL41O60662 606 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 MANEAQ5SRI9 462 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 TLDC1Q6P9B6 456 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 DDIASQ8IXT1 998 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 AICDAQ9GZX7 198 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 OR51B5Q9H339 312 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL31Q9H511 634 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 BRF2Q9HAW0 419 aa28.14■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 TIAF1O95411 115 aa28.13■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 ETHE1O95571 254 aa28.13■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 RAB15P59190 212 aa28.13■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 XKR7Q5GH72 579 aa28.13■■■□□ 2.09
ECHS1-201ENST00000368547 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms