RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, human

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRC-204	ENST00000367379	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PTPRB	P23467	1997 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FLNC	Q14315	2725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379		A0A087WV48	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FFAR2	O15552	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	LAT	O43561	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	F9	P00740	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CRYAA	P02489	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CKMT2	P17540	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CTPS1	P17812	591 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	RXRG	P48443	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PLK1	P53350	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CDH4	P55283	916 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	STX17	P56962	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PDCL	Q13371	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MORC3	Q14149	939 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DLG2	Q15700	870 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ATM	Q13315	3056 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379		A0A1W2PR77	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PLK4	O00444	970 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MCF2L	O15068	1137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SLC31A1	O15431	190 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	RTN2	O75298	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	GRAP2	O75791	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	KDM4B	O94953	1096 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CBX6	O95503	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CALCA	P01258	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ALPPL2	P10696	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	AKT2	P31751	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	ACTN2	P35609	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CENPA	P49450	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SEMG2	Q02383	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	BTK	Q06187	659 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	NME3	Q13232	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRC-204	ENST00000367379	TAF5	Q15542	800 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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