RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PTHP01270 115 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DNTTP04053 509 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CTSLP07711 333 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HSMCR30P0CW71 290 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CTSAP10619 480 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SPNP16150 400 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SOAT1P35610 550 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SERPINB10P48595 397 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 METAP1P53582 386 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MVDP53602 400 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 AP1S2P56377 157 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RAB15P59190 212 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 STARD3Q14849 445 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TIGD6Q17RP2 521 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MPEG1Q2M385 716 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LGI4Q8N135 537 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CPXM2Q8N436 756 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GGHQ92820 318 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 VWCEQ96DN2 955 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 EPYCQ99645 322 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TCF25Q9BQ70 676 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DOHHQ9BU89 302 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 OR51B5Q9H339 312 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CDH23Q9H251 3354 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 METTL15A6NJ78 407 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 E9PQ18 207 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PCDH17O14917 1159 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DSCR3O14972 297 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 NPC1O15118 1278 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GRM6O15303 877 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 KDM1AO60341 852 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PRAMEF10O60809 474 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLCO2B1O94956 709 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 LRG1P02750 347 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CXCL10P02778 98 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TIMP2P16035 220 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 VIPR1P32241 457 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PCGF2P35227 344 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 GGT2P36268 569 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PTPN5P54829 565 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TBPL1P62380 186 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLC7A9P82251 487 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 VEZF1Q14119 521 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 UTS2BQ765I0 119 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ADIPOR2Q86V24 386 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RNF130Q86XS8 419 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CPA6Q8N4T0 437 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 S100ZQ8WXG8 99 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLC38A4Q969I6 547 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM159Q96B96 161 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 Q96MT0 163 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 CENPOQ9BU64 300 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRR-202ENST00000342084 SPG21Q9NZD8 308 aa6.98□□□□□ -1.29
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