RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LIMS1-202ENST00000338045 NDUFS4O43181 175 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 B3GALT4O96024 378 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LAMP1P11279 417 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GCKP35557 465 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 ARFIP1P53367 373 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SLC34A1Q06495 639 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 HYAL2Q12891 473 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TSSK4Q6SA08 328 aa14.77□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.77□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MUC13Q9H3R2 512 aa14.77□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.77□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 C2orf74A8MZ97 194 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 B4DGG1 531 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 H3BNX3 289 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 YY2O15391 372 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 C8BP07358 591 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 FURINP09958 794 aa14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 HTR1EP28566 365 aa14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MTPNP58546 118 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TAS2R50P59544 299 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CPTPQ5TA50 214 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 LMX1AQ8TE12 382 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 EDAQ92838 391 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SH3GL1Q99961 368 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 STOML1Q9UBI4 398 aa14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GSAPA4D1B5 854 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 CDKN2CP42773 168 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 GSTM5P46439 218 aa14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 LCN8Q6JVE9 175 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 SPESP1Q6UW49 350 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TRIM73Q86UV7 250 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NUDT13Q86X67 352 aa14.76□□□□□ -0.05
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LIMS1-202ENST00000338045 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 OR10G6Q8NH81 332 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 MIEF2Q96C03 454 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC115Q96NT0 180 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 UCK1Q9HA47 277 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.76□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.75□□□□□ -0.05
LIMS1-202ENST00000338045 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.75□□□□□ -0.05
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