RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CD180Q99467 661 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 LRP8Q14114 963 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 TPT1P8Q9HAU6 139 aa21.65■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GSK3BP49841 420 aa21.65■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.64■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A8Q8TCC7 542 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-201ENST00000332175 AASSQ9UDR5 926 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-201ENST00000332175 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.64■■□□□ 1.05
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PTPRM-201ENST00000332175 PON3Q15166 354 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRM-201ENST00000332175 LAMP5Q9UJQ1 280 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.63■■□□□ 1.05
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF227Q86WZ6 799 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 SCAMP4Q969E2 229 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ACTL8Q9H568 366 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 C14orf105Q9NVL8 296 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 OR6C74A6NCV1 312 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 ITIH1P19827 911 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRM-201ENST00000332175 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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