RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324685.10

RNF40-201, Transcript of ring finger protein 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF40, Length 5,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40-201ENST00000324685 FAM189A1O60320 539 aa20.37■□□□□ 0.85
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RNF40-201ENST00000324685 C12orf42Q96LP6 360 aa20.37■□□□□ 0.85
RNF40-201ENST00000324685 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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RNF40-201ENST00000324685 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.35■□□□□ 0.85
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