RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323699.8

DEGS1-201, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DEGS1, Length 2,101 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-201ENST00000323699 RGS6P49758 472 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 OLR1P78380 273 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 NAE1Q13564 534 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 RAB33AQ14088 237 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 STX19Q8N4C7 294 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 OR7G3Q8NG95 312 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.95□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 PTHP01270 115 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 GSTT2P0CG29 244 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 GSTT2BP0CG30 244 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 TNFRSF1BP20333 461 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.023e-8■□□□□ 10.9
DEGS1-201ENST00000323699 NUDT6P53370 316 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 SPIBQ01892 262 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 RBBP4Q09028 425 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ST3GAL4Q11206 333 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 E2F2Q14209 437 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 COX20Q5RI15 118 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 CCDC80Q76M96 950 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 NLRP8Q86W28 1048 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 LGI4Q8N135 537 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 OR51E2Q9H255 320 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 COL4A6Q14031 1691 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 SCN5AQ14524 2016 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 PLXNA2O75051 1894 aa14.94□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 A0A1W2PQ67 120 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 PLK4O00444 970 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 OPN1SWP03999 348 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ETFAP13804 333 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ETV6P41212 452 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 CRATP43155 626 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 SEPHS1P49903 392 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 CDH12P55289 794 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 LHX8Q68G74 356 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 OR52J3Q8NH60 311 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 TMEM202A6NGA9 273 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 HAT1O14929 419 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 SNPHO15079 494 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ZNF30P17039 623 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ITGA2P17301 1181 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 OR1E2P47887 323 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 UGT2B15P54855 530 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 HBA1P69905 142 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ZNF385BQ569K4 471 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 AKAP14Q86UN6 197 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 OR56A3Q8NH54 315 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 SCAMP4Q969E2 229 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 MED8Q96G25 268 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 CTRCQ99895 268 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 CENPOQ9BU64 300 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 IFT52Q9Y366 437 aa14.93□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 PCM1Q15154 2024 aa14.92□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.92□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 SH3BGRLO75368 114 aa14.92□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 SNX4O95219 450 aa14.92□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 HLA-FP30511 346 aa14.92□□□□□ -0.02
DEGS1-201ENST00000323699 LIMS1P48059 325 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms