RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295887.5

CDS1-201, Transcript of CDP-diacylglycerol synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1-201ENST00000295887 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 NDUFA5Q16718 116 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 PGBD5Q8N414 524 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 IGSF21Q96ID5 467 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 GJD2Q9UKL4 321 aa16.05■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 CLCNKAP51800 687 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 BORAQ6PGQ7 559 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 NUDT13Q86X67 352 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 LINC01465Q8N7H1 131 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 IRGMA1A4Y4 181 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ETFAP13804 333 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 CTSEP14091 401 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 NT5EP21589 574 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SPARTQ8N0X7 666 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 UFD1Q92890 307 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 NUS1Q96E22 293 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 CRELD1Q96HD1 420 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 GPR78Q96P69 363 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 DOHHQ9BU89 302 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 HCSTQ9UBK5 93 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 BTN3A3O00478 584 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 OR6A2O95222 327 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 HLA-EP13747 358 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 RPS26P62854 115 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 IER5LQ5T953 404 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 FUOMA2VDF0 154 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 URADA6NGE7 173 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 WASH4PA8MWX3 477 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 LEFTY1O75610 366 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 CDK5R2Q13319 367 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 MMP27Q9H306 513 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 REEP4Q9H6H4 257 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 IL36AQ9UHA7 158 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.04■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 LEFTY2O00292 366 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 CHST10O43529 356 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 CST9Q5W186 159 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 GHDCQ8N2G8 530 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SCAIQ8N9R8 606 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 RFKQ969G6 155 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 VMP1Q96GC9 406 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ERI3O43414 337 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SMIM18P0DKX4 95 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 RCVRNP35243 200 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 CD83Q01151 205 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 GRM2Q14416 872 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 CADM2Q8N3J6 435 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TDP1Q9NUW8 608 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 HHLA1C9JL84 531 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 JUPP14923 745 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ZNF30P17039 623 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 HTR1BP28222 390 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SLC9A5Q14940 896 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 KLHL22Q53GT1 634 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 KCTD7Q96MP8 289 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.03■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 AMD1P17707 334 aa16.02■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 IDNKQ5T6J7 187 aa16.02■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa16.02■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 LCN9Q8WX39 176 aa16.02■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ITFG2Q969R8 447 aa16.02■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 MGLLQ99685 303 aa16.02■□□□□ 0.16
CDS1-201ENST00000295887 ASPNQ9BXN1 380 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms